 Книжкові видання та компакт-диски Журнали та продовжувані видання Автореферати дисертацій Реферативна база даних Наукова періодика України Тематичний навігатор Авторитетний файл імен осіб
 |
Для швидкої роботи та реалізації всіх функціональних можливостей пошукової системи використовуйте браузер
"Mozilla Firefox" |
|
|
Повнотекстовий пошук
Пошуковий запит: (<.>A=Ширина Т$<.>) |
Загальна кількість знайдених документів : 6
Представлено документи з 1 до 6
|
| 1. |
Ширина Т. В.
Стехиометрия РНП-комплекса полиэдров вируса ядерного полиэдроза тутового шелкопряда Bombyx mori [Електронний ресурс] / Т. В. Ширина, М. Т. Бобровская, Э. А. Козлов // Український біохімічний журнал. - 2012. - Т. 84, № 1. - С. 60-66. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BioChem_2012_84_1_10
Методом гель-фильтрации на колонке Sephacryl S-300 показано, что входящий в полиэдры вируса ядерного полиэдроза Bombyx mori комплекс РНП А имеет молекулярную массу (Мм) около 700 кДа. Показано, что РНП А с Мм 788 кДа формируется из двух 13S-ассоциатов полиэдрина с Мм 342 кДа, двух полипептидов р14 с Мм 14 кДа, двух малых некодирующих РНК с Мм 21 кДа и двух малых некодирующих РНК с Мм 17 кДа. Предлагается модель образования комплекса РНП А из составляющих его компонентов. Обсуждена роль комплекса в формировании полиэдра и его роль в инфекционном процессе.
| | 2. |
Ширина Т. Г.
Проблемы украинского рынка консультационных услуг [Електронний ресурс] / Т. Г. Ширина // Управління розвитком. - 2013. - № 16. - С. 58-61. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/Uproz_2013_16_25
| | 3. |
Ширина Т. В.
Поиск генов микроРНК в антипараллельных цепях участков генома вируса ядерного полиэдроза Аutographa californica, включающих самые поздние и комплементарные гены [Електронний ресурс] / Т. В. Ширина, М. Т. Бобровская, Э. А. Козлов // Український біохімічний журнал. - 2011. - Т. 83, № 4. - С. 41-49. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BioChem_2011_83_4_7
Отмечено, что вирусы ядерного полиэдроза (ВЯП) B. mori кодируют два очень поздних гена - ph и p10. Интерес к поиску генов miR в этих участках генома обусловлен тем, что полиэдры, образующиеся на очень поздней стадии инфекции, включают не только вирионы, но и малую РНК длиной 50 - 60 нуклеотидов. Цель сообщения состояла в поиске miRs в альтернативных транскриптах, синтезируемых не только с TAAG-промоторного элемента, но и с ТАТА-промоторных элементов, расположенных в участках генома ВЯП B. mori, включающих гены ph и p10. Поиск miRs осуществлен с помощью биоинформатических программ предсказания miR: MiPred, miRNA SVM, Micropocessor SVM и RNAfold. Предсказано, что участок, содержащий ген ph, может кодировать две miRs (bmoNPV-miR-1ph, bmoNPV-miR-2ph) и один потенциальный (С) предшественник miR - bmoNPV-pre-miR-1Cph, не являющийся субстратом для фермента Dicer. Участок, содержащий ген p10, может кодировать одну предсказанную miR - bmoNPV-miR-3p10. Выводы: обсуждена возможность регуляции экспрессии предсказанными miRs генов orf 1629 и p74, расположенных в тех же участках комплементарной цепи.За допомогою біоінформативного методу шляхом аналізу вторинної структури альтернативних транскриптів показано, що ген ph вірусу ядерного поліедрозу Аutographa californica кодує дві зрілі мікроРНК і три потенційні мікроРНК. Комплементарний до гена ph ген orf1629 не кодує ні зрілі мікроРНК, ні потенційні мікроРНК. Ген р10 кодує зрілу мікроРНК і потенційну. Локалізований на комплементарному ланцюзі ген р74 кодує три зрілих мікроРНК.Проведен поиск генов микроРНК в участках генома вируса ядерного полиэдроза Bombyx mori, комплементарных самым поздним генам. Разработан алгоритм поиска in silico микроРНК в отдельно взятых участках генома бакуловирусов. Показано, что ген orf4 вируса ядерного полиэдроза Bombyx mori, комплементарный гену ph, кодирует потенциальную микроРНК. Ген р74, комплементарный гену р10, кодирует зрелую микроРНК и потенциальную микроРНК. Ген orf1629 кодирует две малые некодирующие РНК, комплементарные участкам мРНК полиэдрина в 5'-конце orf. На основании полученных результатов предполагается, что малые некодирующие РНК, комплементарные участкам мРНК полиэдрина, включаются в полиэдры.
| | 4. |
Ширина Т. В.
Поиск генов микроРНК в участках генома вируса ядерного полиэдроза Вombyx mori, комплементарных самым поздним генам [Електронний ресурс] / Т. В. Ширина, М. Т. Бобровская, Э. А. Козлов // Український біохімічний журнал. - 2011. - Т. 83, № 5. - С. 59-66. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BioChem_2011_83_5_10
Отмечено, что вирусы ядерного полиэдроза (ВЯП) B. mori кодируют два очень поздних гена - ph и p10. Интерес к поиску генов miR в этих участках генома обусловлен тем, что полиэдры, образующиеся на очень поздней стадии инфекции, включают не только вирионы, но и малую РНК длиной 50 - 60 нуклеотидов. Цель сообщения состояла в поиске miRs в альтернативных транскриптах, синтезируемых не только с TAAG-промоторного элемента, но и с ТАТА-промоторных элементов, расположенных в участках генома ВЯП B. mori, включающих гены ph и p10. Поиск miRs осуществлен с помощью биоинформатических программ предсказания miR: MiPred, miRNA SVM, Micropocessor SVM и RNAfold. Предсказано, что участок, содержащий ген ph, может кодировать две miRs (bmoNPV-miR-1ph, bmoNPV-miR-2ph) и один потенциальный (С) предшественник miR - bmoNPV-pre-miR-1Cph, не являющийся субстратом для фермента Dicer. Участок, содержащий ген p10, может кодировать одну предсказанную miR - bmoNPV-miR-3p10. Выводы: обсуждена возможность регуляции экспрессии предсказанными miRs генов orf 1629 и p74, расположенных в тех же участках комплементарной цепи.За допомогою біоінформативного методу шляхом аналізу вторинної структури альтернативних транскриптів показано, що ген ph вірусу ядерного поліедрозу Аutographa californica кодує дві зрілі мікроРНК і три потенційні мікроРНК. Комплементарний до гена ph ген orf1629 не кодує ні зрілі мікроРНК, ні потенційні мікроРНК. Ген р10 кодує зрілу мікроРНК і потенційну. Локалізований на комплементарному ланцюзі ген р74 кодує три зрілих мікроРНК.Проведен поиск генов микроРНК в участках генома вируса ядерного полиэдроза Bombyx mori, комплементарных самым поздним генам. Разработан алгоритм поиска in silico микроРНК в отдельно взятых участках генома бакуловирусов. Показано, что ген orf4 вируса ядерного полиэдроза Bombyx mori, комплементарный гену ph, кодирует потенциальную микроРНК. Ген р74, комплементарный гену р10, кодирует зрелую микроРНК и потенциальную микроРНК. Ген orf1629 кодирует две малые некодирующие РНК, комплементарные участкам мРНК полиэдрина в 5'-конце orf. На основании полученных результатов предполагается, что малые некодирующие РНК, комплементарные участкам мРНК полиэдрина, включаются в полиэдры.
| | 5. |
Ширина Т. В.
Идентификация малых РНК в полиэдрах вируса ядерного полиэдроза Bombyx mori [Електронний ресурс] / Т. В. Ширина, А. В. Геращенко, М. Т. Бобровская, В. И. Кашуба // Ukrainian Biochemical Journal. - 2014. - Vol. 86, № 2. - С. 101-106. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BioChem_2014_86_2_13
Биоинформативными методами показано, что в участках генома вируса ядерного полиэдроза Bombyx мori закодированы две малые РНК - snc RNA-1 и snc RNA-2, которые могут выполнять структурную функцию при формировании кристаллов полиэдров. Цель работы - установление нуклеотидной последовательности малых некодирующих РНК, предсказанных биоинформативными методами, из полиэдров B. mori. Использованы полимеразная цепная реакция (ПЦР), электрофорез в агарозном геле, клонирование продуктов ПЦР, секвенирование. Установлено, что нуклеотидные последовательности snc RNA-1 и snc RNA-2 комплементарны участкам мРНК полиэдрина, которые включаются в полиэдры B. mori. Эти РНК имеют 100 %-ю идентичность с последовательностями, предсказанными нами биоинформативными методами. Полученные результаты подтверждают предложенный ранее биоинформативный подход по поиску малых РНК, закодированных в геноме B. mori.
| | 6. |
Башта О. В.
Антифунгальна та рістрегулююча дія нових металоорганічних сполук [Електронний ресурс] / О. В. Башта, Л. П. Пасічник, Н. М. Волощук, Г. Г. Репіч, О. О. Жолоб, О. В. Васильченко, О. С. Сорокін, Т. В. Ширина, С. І. Орисик, Л. Г. Пальчиковська // Вісник Українського товариства генетиків і селекціонерів. - 2018. - Т. 16, № 2. - С. 143-149. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/Vutgis_2018_16_2_3
|
|
|
Простий
Розширений
Попередній перегляд: 
Реферативна БД
Пам`ятка користувача